Chemistry

Selasa, 10 Desember 2013

Software Kimia Untuk Pembelajaran Struktur dan Penamaaan Alkana, Alkena dan Alkuna



Cara menggambar rumus struktur senyawa hidrokarbon dengan menggunakan ChemSketch adalah sebagai berikut:
  1. Buka ChemSketch dari Star-Program-ACDLabs12-Chemsketch. Pada keadaan standar (default) ChemSketch dalam mode Structure.
  1. Agar semua atom C muncul nantinya, atur propertiesnya dari Tools-Stucutures Properties. Caranya Centang All pada Show Carbons pada tab Common.


  1. Pastikan ada pada mode Stukture dan bukan pada mode Draw.
  2. Klik Atom C pada menu yg ada disamping kiri layar kerja chemsketch.
  3. Drag kemudian klik sekali untuk membuat satu C (metana) dan drag lagi dengan menyambung C pertama itu dan klik untuk menambah satu atom C untuk menjadi etana. Begitu seterusnya, untuk membuat percabangan tinggal klik pada C utama yang akan dijadikan tempat percabangan kemudian di drag dan klik.
  1. Pastikan rumus struktur yg digambar pada langkah sebelumnya terpilih, jika belum klik toolbar yang persis di bawah tulisan mode draw. Kemudian lakukan penseleksian struktur untuk tujuan menampilkan secara stukutur terkembang dengan atom H dan C nampak. Caranya klik Tools-Add explicit hydrogens. Jika berhasil maka tampilannya menjadi seperti dibawah ini.

  1. Untuk menyalinnya agar bisa dikopikan ke dalam microsoft word, pindahkan dari mode Structure ke mode Draw
  2. Salin (copy) rumus struktur yang sudah jadi kemudian letakkan (rekatkan/paste) dalam microsoft word.



Secara langsung kita bisa membuat rumus molekul atau rumus struktur, dari 2 dimensi (2D) diubah menjadi 3 dimensi (3D)dengan beberapa pilihan model tampilan. Pada Chemsketch tersedia tampilan wireframe, ball & stikcs, stikcs, spacefill, dots only, disk, with dots.








 










Untuk dapat melihat bentuk molekul 3D maka harus membuka 3d Viewer yang satu paket dari software kimia ini. Lakukan pengkonversian 2D ke 3D. Caranya setelah menggambar molekul 2 D dengan benar lakukan pengkopian struktur 2D tadi ke 3D dengan klik menu copy to 3D dan silahkan klik 3D-View. Menu ini terletak dibagian




pojok kiri bawah. Tampilan dari 2 dimensi untuk diubah menjadi 3 dimensi diperlukan langkah optimasi 3D terlebih dahulu agar bentuk molekul tidak terlalu melenceng dari keadaan nyatanya. Caranya setelah ACD/3D Viewer terbuka dan telah dilakukan pengkopian molekul, klik menu Tools dan pilih 3D-Optimization. Untuk dapat melakukan penamaan struktur yang digambarkan klik Menu Tools —> Generate —> Name for structure.

source : http://urip.wordpress.com/tag/hidrokarbon/